主债务是否包括利息以及违约金，要按当事人之间的约定，如果合同中有约定利息和违约金的，主债务就包括利息和违约金。清偿债权应该按照实现债权的有关费用、利息、主债务的顺序进行。
【法律依据】
《民法典》第五百六十一条，债务人在履行主债务外还应当支付利息和实现债权的有关费用，其给付不足以清偿全部债务的，除当事人另有约定外，应当按照下列顺序履行：
（一）实现债权的有关费用；
（二）利息；
（三）主债务。