耐水腻子与普通腻子的强度、使用寿命以及两者之间的特点有所不同。耐水腻子的标准状态粘结强度可以达到0.5Mpa，而普通腻子的标准状态粘结强度为0.3Mpa。并且耐水腻子的使用寿命可以达到十年左右，而普通腻子的使用寿命仅为三年至五年左右。除此之外，耐水腻子在水中浸四十八小时不会发生开裂、起皮的现象，并且耐水腻子具有环保的特点，而普通腻子则会产生脱落的现象，且不具有环保的特点。在成本方面，耐水腻子的成本比普通腻子要更高一些。