猪小袋纤毛虫病是由小袋科的结肠小袋纤毛虫寄生于人、猪大肠内引起的疾病。 小袋纤毛虫在猪肠道中寄生时，分为活动期虫体（滋养体）和非活动期虫体（包囊）两种形态。滋养体以二分裂法进行繁殖，并形成包囊，随宿主的粪便排出体外（滋养体直接排出体外者也可在外界形成包囊），如被另外的猪吞食，可引起新的感染。滋养体型纤毛虫以宿主肠内淀粉、肠壁细胞和细菌为食物，一般情况下致病力不强，只引起宿主腹泻。但猪(特别是仔猪）在严重感染或有其他肠道病时，有利于小袋虫的大量繁殖。滋养体可侵人猪大肠组织内增殖，引起溃疡性结肠炎。