办理流程为：
1、用数字证书用户注册。经办人使用数字证书登录深圳市市场和质量监督管理委员会网上注册系统，按照网页提示填写经办人基本信息，完成用户注册。
2、填报信息。经办人进入全流程电子登记系统，在电子申请表上按规范格式填写申请信息，
3、电子签名。在核对电子申请表的信息内容无误后，经办人、法定代表人、股东及董事成员等相关签字人均需按要求使用数字证书进行电子签名。
4、验证签名信息。完成全部电子签名后，在连接互联网的情况下，点击申请表上的“提交”，完成提交申请，由网上注册系统自行验证相关签字人信息。
5、网上审核。
6、网上发放电子营业执照。商事登记机关网上审核后，经办人可登记网上注册系统查看办理结果，准予登记的，经办人可在网上注册登记系统查看到电子营业执照并可下载其复制件。