养殖基地遇到拆迁，补偿涉及到几个部分：
第一，土地的补偿，土地是自己的承包地，土地确权明确，土地可以获得补偿，如果是租用的土地，土地补偿归实际承包权人所有；
第二，养殖基地建筑物、附属物的补偿，根据养殖基地实际建筑面积、建筑结构以及附属设施综合评估计算补偿金额；
第三，停产停业损失的补偿，有合法的养殖手续和营业执照，根据实际产值情况可以获得停产停业损失的补偿；
第四，设备折旧及搬迁的补偿，养殖基地内的设施设备评估后折旧的补偿，养殖基地剩余物料搬迁时产生的搬迁费等都可以获得补偿。
第五，禽畜出清补偿，这一项补偿一般是按照存栏禽畜的大小和种类进行补偿。为了改善城乡环境，2016年开始国家出台禁养区相关政策，在指定范围内禁止任何单位和个人养殖畜禽，同时要求已建成的养殖基地依法关闭。禁养区政策实施后，很多养殖基地面临拆迁，合法有证的养殖基地都应当有偿拆迁，对于一些手续不全的养殖基地也要根据具体情况分析，违法建设的养殖基地严格意义上是不予补偿的。在养殖基地面临拆迁时最好能及时咨询专业拆迁律师。