合同解除后仲裁协议有效。合同解除后仲裁协议效力是不会改变的，因为合同中的仲裁条款是解决合同纠纷的独立条款，不会随合同解除而失效。
解除合同关系后仍留有纠纷的，可依据该条款约定申请仲裁。
【法律依据】
《民法典》第五百六十七条，合同的权利义务关系终止，不影响合同中结算和清理条款的效力。