1、主要的负责对象不同

一般情况下，大学中的班导师主要是在班级同学的专业知识、学术比赛、实践、实习、就业等方面为同学提供帮助的职位；而辅导员则是对全院同学的纪律、处罚、奖励、住宿、思想和心理等方面提供帮助。

班导师所负责的同学数量较少，一般能够在学业上为同学提供很大的帮助；而辅导员负责的同学数量较多，可能对绝大多数大学学生的帮助不大。

2、主要的职责有所不同

班导师：通常情况下，大学所配备的班导师的主要职务是在班级学生的学习方面、班级学风建设、班级评定和学风建设等方面给予帮助；与初高中的班主任有所不同，大学所配备的班导师与同学的接触时间较少，部分同学甚至一学期也无法见到班导师几次；但是班级中班级学风建设、班干部的评选、期末的班级总结会议等均会出现班导师的身影；若学生在学习方面、科学研究方面、论文发表、竞赛了解等方面有所疑惑，均可以寻求班导师的帮助。

辅导员：通常情况下，大学所配备的辅导员的主要职务是在全院学生中开展相应的思想政治道德教育，并且在德智教育的同时，做好学生心态方面的工作。学生的综合测评、宿舍选拔文明寝室、班级评选、社会实践、就业指导、安全教育、党支部和团支部的相关活动均由辅导员负责。