一、运输合同纠纷如何处理？

1、协商

合同当事人在友好的基础上，通过相互协商解决纠纷，这是最佳的方式。

2、调解

合同当事人如果不能协商一致，可以要求有关机构调解如，一方或双方是国有企业的，可以要求上级机关进行调解。上级机关应在平等的基础上分清是非进行调解，而不能进行行政干预。当事人还可以要求合同管理机关、仲裁机构、法庭等进行调解。

3、仲裁

合同当事人协商不成，不愿调解的，可根据合同中规定的仲裁条款或双方在纠纷发生后达成的仲裁协议向仲裁机构申请仲裁。

4、诉讼

如果合同中没有订立仲裁条款，事后也没有达成仲裁协议，合同当事人可以将合同纠纷起诉到法院，寻求司法解决。除了上述一般特点之外，有些合同还具有其自愿的特点，如涉外合同纠纷，解决时可能会援引外国法律、而不是中国相关的合同方面的法律。

二、合同纠纷起诉流程有哪些?

1、确定诉讼管辖的法院

法院是否有管辖权，主要是约定管辖和法定管辖两种方式确定，合同双方在合同签订时可能会对诉讼纠纷可能管辖的法院作出选择，双方经过协商约定好管辖的法院。

如果双方没有约定管辖法院的，按照法定管辖来觉得，一般包括被告住所地、合同签订地及合同履行地等管辖法院，不同类型的合同，其管辖法院也有所不同，具体需要看法律规定。

2、书写起诉状，整理好相关的诉讼材料

到法院起诉，需要有起诉状，原被告的基本信息以及相关的证据材料，有诉讼代理人的，还需要代理人的身份信息，现有证据包括合同及合同履行的相关材料，要求是原件。如果某些材料不是原件，应让律师审查是否会影响诉讼结果。

3、法庭辩论质证

立案介绍后法院发送传票，确定开庭时间，也会对原被告双方的证据材料进行交换，对于证据的真伪及证明力大小等各方面在法庭进行辩论，有新证据的，也可提交。

4、判决生效阶段

法庭辩论之后，法院经过调查分析，认定案件事实经过，作出合法合理的判决，对于判决结果有异议的，可提起上诉，请求上一级法院进行判决。

合同诉讼纠纷的流程主要包括选择具有管辖权的法院，收集相关的证据材料，书写起诉状进行立案，开庭时可在法庭辩论，发表质证意见，最后对于判决结果有异议的，可上诉，申请再审。

运输合同纠纷也是常见的民事合同纠纷，在运输合同中，如果是双方当事人之间就托运的方式、托运的价款等事项发生纠纷的，可以选择多种方式处理，如果是选择诉讼方式处理的，需要收集案件相关的证据，因为只有充足的证据才可以支持自己的诉讼请求。