无籽西瓜是目前大面积种植的主要西瓜品种类型，它是四倍体西瓜与两倍西瓜（普通有籽西瓜）的杂交种，即三倍体西瓜。生产上常采用对四倍体西瓜自然隔离法人工去雄生产三倍体西瓜种子。少数情况下由于制种过程中四倍体西瓜去雄不彻底，故出现无籽西瓜种（三倍体西瓜种）中混杂有少量的四倍体西瓜，即假无籽西瓜种。四倍体西瓜无论是产量性状和品质都不如三倍体西瓜，因此必须把四倍西瓜种从无籽西瓜种中清除出去。如果清除不彻底，无籽西瓜中仍可能混杂有四倍体西瓜种。个别情况下有人故意把四倍西瓜或两倍体西瓜种混杂在无籽西瓜种牟利，更要注意辨别清除。

可根据上述3类西瓜种特征辨别。无籽西瓜种子（三倍体种子）的种胚不充实，种壳表面常凹陷不平，种脐部珠眼突起，种壳上有较深的木栓质纵裂，种籽明显比两倍体西瓜大。四倍体西瓜种子的种胚充实，种子圆壮，这是与无籽西瓜种明显区别。此外，四倍体西瓜种种壳表面常突起，种壳上一般有木栓质纵裂，种脐部珠眼突起。两倍体西瓜种的种粒明显小于无籽西瓜种和四倍体西瓜种，种脐部珠眼不突起，脐部较窄，种壳上无纵裂。