和田黄玉是一种珍贵的矿石，其化学成分主要由透辉石、透石榴石和其他少量矿物组成。其晶体结构属于透辉石类矿物的晶体结构，具体可表述为：六方最密堆积结构。

在和田黄玉的晶体结构中，透辉石和透石榴石矿物以六角形排列在一起，形成紧密的堆积结构。这种结构使得和田黄玉具有坚硬、致密、透光等特点。

需要注意的是，和田黄玉的结构也会受到自然因素和地质作用的影响，使其形成不同的结晶形态和结构特征。因此，在不同的地质环境和生长条件下，和田黄玉的结构也可能会有所变化。