1、防潮保存。藏红花和其他的花类中药一样很怕潮湿，而且藏红花的花柱头很容易受潮霉变，防潮保存是保存藏红花的关键。藏红花直接放在空气中都能吸收空气中的水分潮湿，霉变之后的藏红花严重影响其药效和保质期。

2、避光保存。藏红花中含有挥发性的油性成分，在经过阳光照晒之后会有挥发，严重的影响藏红花的功效。

3、冷藏保存。生活中低温保存是最常见的保存食物和药物的方法之一，藏红花也一样，经过密封之后即可冷藏保存，只要避免其在低温环境下受潮，低温能延长臧红花的保质期，也能使其药效保存的比较完全。