二者区别如下：
1.对于事实婚姻国家只承认1994年2月1日以前形成的事实婚姻；对于合法婚姻，不论什么时候缔结婚姻关系都受法律保护。
2.含义不同。事实婚姻是指男女双方的同居行为始于1994年2月1日以前，以夫妻名义进行的的同居，同居双方1994年以前同居时已经具备结婚的实质要件。合法婚姻，是指符合法定条件的男女，按照法律规定的程序建立夫妻关系的民事法律行为。
【法律依据】
根据《民法典》第一千零四十九条规定：要求结婚的男女双方应当亲自到婚姻登记机关申请结婚登记。符合本法规定的，予以登记，发给结婚证。完成结婚登记，即确立婚姻关系。未办理结婚登记的，应当补办登记。