一、劳动合同主体变更经济补偿金怎么算?

按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算;不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。这里的月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。

劳动者非因本人原因从原用人单位被安排到新用人单位工作，原用人单位未支付经济补偿，劳动者依照《劳动合同法》第38条规定与新用人单位解除劳动合同的，在计算经济补偿金时，劳动者请求把在原用人单位的工作年限合并计算为新用人单位工作年限时，人民法院应予支持。

二、解除劳动合同的经济补偿金扣税吗?

解除劳动合同的经济补偿金，达到法定征税标准的，应当缴纳个人所得税。

用人单位裁员应当支付的经济补偿金，其收入在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税。超过的部分，可视为一次取得数月的工资、薪金收入，允许在一定期限内进行平均。

具体平均办法为：以个人取得的一次性经济补偿收入，除以个人在本企业的工作年限数，以其商数作为个人的月工资、薪金收入，按照《税法》规定计算缴纳个人所得税，由支付单位在支付时一次性代扣代缴。

个人在本企业的工作年限数按实际工作年限数计算，超过12年的按12计算。

变更劳动合同支付给员工的经济补偿金，与员工在单位的工作时间密切相关。劳动者和单位解除劳动合同之后，所获得的经济补偿金，如果达到了法定征税标准，就应该缴纳个人所得税。经济补偿金是由用人单位一次性支付的，属于员工的一次性收入，经济补偿金缴纳的税款可以由用人单位代缴。