一、停薪留职合同可以代替劳动合同吗

停薪留职合同可以代替劳动合同的。常情况下，企业职工停薪留职的原因一般是由于员工自身方面的原因，当然如果公司经营当然存在问题，也可能会存在这种情况，因为公司的原因停薪留职的办理需要我们慎重考虑。停薪留职协议的有效期间应当以劳动合同约定期间为限，不应超过劳动合同的约定期间。

二、应该如何办理停薪留职

(一)停薪留职的对象

停薪留职的对象，主要是企业中富余人员、企业的科技人员、技术工人以及其他职工要求到我省城乡创办、领办企业特别是到乡镇企业、贫困地区从事科技开发、承包、兴办开发性企业的，也可以停薪留职。

(二)停薪留手续的办理

要求停薪留职的职工，应由本人提出书面申请，报所在单位批准。企业与批准停薪留职的职工应签订停薪留职合同，并报企业主管部门和企业所在地劳动部门备案。

合同由双方共同商定，其内容应当包括：停薪留职的期限(不超过3年)、停薪留职期间工资和劳保福利待遇的处理、工龄计算以及双方认为需要明确的其他事项等。

未经批准擅自离职的，所在单位按违反劳动纪律处理。

(三)停薪留职期间有关问题的处理

1、工资待遇问题：在停薪留职期间停发工资、奖金和各种津贴、补贴(包括房贴)等，本人标准工资作为档案工资保留。

2、劳保福利待遇问题：职工在停薪留职期间，不享受原单位的各种福利待遇、劳保津贴和劳动保护用品。

3、工龄计算问题：职工在停薪留职期间，应按月向原单位缴纳退休养老基金、待业保险基金等，缴纳的可以计算连续工龄，不缴纳的不计算连续工龄。其缴纳的数额(含个人缴纳部分)，不少于职工在停薪留职前月工资总额的25%，职工停薪留职期间或期满后回原单位工作符合退休年龄时，由原单位办理退休手续。

4、工伤事故处理问题：职工在停薪留职期间被聘用的，正常死亡或伤亡或发生伤亡事故，由聘用单位负责处理，造成丧失劳动能力或死亡的，其各项费用由聘用单位负责。

职工停薪留职后自谋职业的。如发生正常或意外伤亡事故的，一律作为非因工处理。其抚恤费用原单位按有关规定发给。

5、职工在停薪留职合同期满要求继续停薪留职的，应在合同期满前向原单位申请，经批准后续订停薪留职合同;如在合同期满后又未办续订手续的，15天内不回原单位报到的，原单位可以除名。

6、职工在停薪留职期间被司法机关送去劳动教养、被判刑的，原单位可以按辞退或开除处理。

企业停薪留职协议的主要内容是针对员工在停薪留职期间的权利和义务作出的规定。停薪留职协议的内容以及员工停薪留职协议的法律效力问题作出的详细介绍。我们可以得知停薪留职协议是具有法律效力的，是我国合同法以及劳动法律的保护。