患病较严重的仔猪精神沉郁、吸乳减少，病猪因脱水而消瘦，皮肤及黏膜苍白，但仍哺乳。一般能自行耐过逐渐恢复，但生长迟缓，同窝仔猪生长发育不均。因球虫造成的死亡率一般为中等程度，但下痢严重或继发感染时使病情加重，死亡率达20%。如果同时感染大肠杆菌、轮状病毒或冠状病毒等，临床症状则更为严重，可出现相关症状。