金刚菩提子反碱是因为它与碱性物质接触而导致的，可以尝试以下方法：

1. 卸下佛珠串放到通风干燥处晾干，除去接触碱性物质的污渍。

2. 用温水和肥皂轻轻洗涤，避免使用过于刺激的清洁剂，以免损坏佛珠。

3. 将佛珠在阳光下晒干，因为阳光能帮助金刚菩提子恢复原来的状态。

4. 如果上述方法仍不能解决问题，建议向专业的佛珠修复师傅咨询，他们能够提供更详细、更专业的修复方法。