传统发酵工程是指利用微生物（如酵母、菌种等）在特定条件下，对特定物质进行发酵，以制造出食品、药物、酒类等产品的一种传统生产工艺。常见的传统发酵工程包括酿酒、酿醋、豆制品、面制品、乳制品等。

在传统发酵工程中，微生物是发酵的主体，通过一系列的代谢过程，将特定的原料转换成食品或药物。在发酵过程中，需要控制温度、湿度、气体组成等因素，以保证微生物能够正常生长繁殖。同时，还需要控制发酵时间、发酵条件等，以保证产品的质量和口感。

传统发酵工程具有工艺简单、投入低、产品营养丰富、口感独特等特点，在一些地方仍然是主要的食品或药品生产方式。但也存在一些问题，如产能有限、工艺难以控制、产品稳定性较差等。随着科技的进步和工程技术的发展，传统发酵工艺逐渐被现代化的生产工艺所替代。