1. 需要严格控制生物发酵过程中的环境因素，例如温度、pH值、氧气浓度等，以确保微生物可以良好生长和生产。

2. 生产过程中需要增加和调节营养物质，例如碳源、氮源、矿物质等，以提高微生物的产率和产品质量。

3. 各种微生物在发酵过程中有不同的需氧程度和酸碱耐受性，因此应选择合适的微生物株进行培养和发酵。

4. 发酵工程具有较高的自动化程度和生物工程技术含量，需要专业的操作技能和设备支持。

5. 发酵工程广泛应用于食品、医药、化工等领域，可以生产各种产品，包括食品添加剂、抗生素、维生素、酶类等。